L’articolo si concentra sull’analisi preliminare delle differenze funzionali del microbioma intestinale tra cavalli sani e cavalli affetti da coliche, una condizione comune e potenzialmente letale che colpisce il tratto gastrointestinale. Attraverso uno studio caso-controllo, sono stati raccolti campioni fecali da 14 cavalli sani e 14 cavalli con coliche. Successivamente, sono state effettuate analisi di sequenziamento massivo del gene 16S rRNA per identificare la composizione batterica e le funzioni metaboliche associate.
Il microbioma intestinale è un ecosistema complesso che contribuisce alla salute degli animali influenzando la digestione, il sistema immunitario e il benessere generale. Nei cavalli, alterazioni della composizione microbica intestinale sono state collegate a patologie come la colite, la sindrome metabolica e le coliche. Tuttavia, non è chiaro se queste alterazioni siano la causa o la conseguenza della malattia. Lo studio mira a identificare i cambiamenti specifici nel microbioma dei cavalli con coliche e a prevedere le implicazioni funzionali di tali alterazioni.
Metodi
I campioni fecali sono stati analizzati utilizzando tecnologie avanzate come QIIME, DADA2 e PICRUSt2, strumenti bioinformatici che permettono di elaborare dati metagenomici e prevedere le funzioni metaboliche. Le analisi statistiche hanno incluso il test U di Mann-Whitney e il metodo UniFrac ponderato per valutare la diversità microbica e le differenze tra i gruppi.
È emerso che i phyla batterici predominanti erano Firmicuteota, Bacteroidota e Pseudomonadota, ma nei cavalli con coliche si è osservata una riduzione della diversità microbica e della ricchezza batterica, parametri associati alla disbiosi. I cavalli con coliche presentavano una riduzione di batteri benefici come Fibrobacter e Solibacillus, noti per il loro ruolo nella digestione della fibra, e un aumento di Streptococcus, un batterio che può contribuire a cambiamenti negativi del pH intestinale.
Dal punto di vista funzionale, nei cavalli sani erano più attivi i percorsi metabolici legati alla biosintesi dell’eme e al ciclo di Krebs (TCA), processi associati alla respirazione aerobica, mentre nei cavalli con coliche erano invece arricchiti i percorsi di biosintesi degli acidi grassi (palmitato, stearato) e di degradazione di aminoacidi (lisina, arginina) e purine. Questi cambiamenti suggeriscono una maggiore attività metabolica che può contribuire a un ambiente pro-infiammatorio. Di conseguenza, la riduzione di batteri come Fibrobacter potrebbe spiegare un’efficienza ridotta nella degradazione della fibra nei cavalli con coliche invece l’aumento di Streptococcus potrebbe essere responsabile di fermentazioni anomale, contribuendo a condizioni infiammatorie nell’intestino.
Discussione
Lo studio suggerisce che i cavalli con coliche mostrano alterazioni discrete ma significative nella composizione e nella funzionalità del microbioma intestinale. Queste variazioni includono la riduzione di batteri benefici e l’aumento di batteri potenzialmente patogeni, insieme a cambiamenti nei percorsi metabolici che indicano una risposta infiammatoria. È importante sottolineare che molti di questi cambiamenti potrebbero essere influenzati da fattori esterni come la dieta, il trattamento pre-ospedaliero o il tipo di colica.
Gli autori sottolineano che una migliore comprensione del microbioma intestinale nei cavalli con coliche potrebbe portare allo sviluppo di nuovi approcci preventivi, diagnostici e terapeutici. Tuttavia, sono necessari ulteriori studi per confermare questi risultati e per esplorare il ruolo delle differenze specifiche nei sottotipi di coliche.
Reference
Thomson P, Garrido D, Santibáñez R, Lara F. Preliminary Functional Analysis of the Gut Microbiome in Colic Horses. Animals (Basel). 2024 Nov 10;14(22):3222. doi: 10.3390/ani14223222.
